Терміни виконання
Ентеропатії
Хвороба Крона — це хронічне рецидивуюче імуно опосередковане запальне захворювання шлунково-кишкового тракту мультифакторіальної природи, що розвивається внаслідок взаємодії генетичної схильності, факторів навколишнього середовища та порушень імунної відповіді. Характеризується сегментарним (вогнищевим) і трансмуральним (із залученням усіх шарів стінки) запаленням, яке може уражати будь-яку ділянку травного тракту — від ротової порожнини до анального каналу.
Важливу роль у схильності до хвороби Крона відіграють генетичні фактори. Зокрема, гени NOD2 та ATG16L1 беруть участь у розпізнаванні бактеріальних компонентів, регуляції імунної відповіді та підтриманні нормального функціонування клітин кишечника. Певні варіанти цих генів асоційовані з підвищеним ризиком розвитку захворювання.
Дослідження «Генетичний профіль ризику хвороби Крона (NOD2 + ATG16L1)» дає змогу виявити чотири генетичні варіанти, пов’язані зі схильністю до цього захворювання. Результати можуть доповнити клінічну оцінку пацієнта та допомогти лікарю краще зрозуміти генетичні фактори ризику в конкретній клінічній ситуації.
Гени NOD2 та ATG16L1 беруть участь у механізмах вродженого імунітету й підтриманні гомеостазу кишечника. Певні варіанти цих генів асоціюються з підвищеним ризиком хвороби Крона, однак їх наявність не означає, що захворювання обов’язково розвинеться.
Значення генів NOD2 та ATG16L1:
NOD2 — розпізнавання бактеріальних компонентів
Ген NOD2 кодує внутрішньоклітинний рецептор, який розпізнає мурамілдипептид — компонент бактеріальної клітинної стінки — та бере участь у регуляції вродженого імунітету.
Три досліджувані варіанти NOD2 (R702W, G908R та 3020insC) у популяційних дослідженнях асоціювалися з підвищеною схильністю до хвороби Крона. Для окремих варіантів описано зв’язок з ураженням клубової кишки та певними фенотипами захворювання . Проте генетичний результат не дає змоги достовірно передбачити індивідуальний перебіг захворювання.
ATG16L1 — аутофагія та кишковий бар’єр
Ген ATG16L1 кодує білок, необхідний для аутофагії — процесу внутрішньоклітинного видалення та переробки пошкоджених компонентів і контролю мікроорганізмів.
Варіанти ATG16L1, зокрема поширений поліморфізм p.Thr300Ala (T300A; rs2241880), асоціюються з ризиком розвитку хвороби Крона. Ця асоціація відображає генетичну схильність, а не наявність активного запалення кишечника.
Дослідження цих генів дає змогу визначити наявність конкретних досліджуваних варіантів генетичної схильності. Його клінічне значення залежить від переліку варіантів, які входять до тесту, сімейного анамнезу та клінічної ситуації.
Генетичне дослідження «Генетичний профіль ризику хвороби Крона (NOD2 + ATG16L1)» може розглядатися в межах спеціалізованої оцінки генетичних факторів або науково-клінічних програм:
1.У пацієнтів із сімейним анамнезом хвороби Крона — для визначення окремих генетичних варіантів, асоційованих зі схильністю до захворювання. В той же час дослідження не є рекомендованим рутинним скринінгом безсимптомних родичів;
2.У пацієнтів із підтвердженою хворобою Крона — для характеристики наявності досліджуваних генетичних варіантів у межах спеціалізованої оцінки або наукового протоколу. Результати не використовують самостійно для визначення прогнозу чи вибору терапії;
3.У пацієнтів, які беруть участь у науково-клінічних дослідженнях — для визначення чотирьох генетичних варіантів NOD2 та ATG16L1, включених до досліджуваної панелі
Зверніть увагу: за підозри на хворобу Крона генетичне дослідження NOD2 + ATG16L1 не повинно замінювати або відтерміновувати стандартне діагностичне обстеження. Воно не рекомендоване як самостійний тест для підтвердження чи виключення захворювання.
Генетичне тестування може бути корисним як додатковий інструмент у вибраних клінічних випадках, але не замінює стандартних методів діагностикиДослідження не є методом діагностики хвороби Крона, не дає змоги встановити її активність, локалізацію або прогнозувати індивідуальний перебіг. Відсутність досліджуваних варіантів також не виключає генетичної схильності чи наявності захворювання.
Метод застосовується для генотипування чотирьох досліджуваних варіантів генів, асоційованих із ризиком розвитку хвороби Крона:
•NOD2 (CARD15) — c.3019_3020insC (3020insC);
•NOD2 (CARD15) — c.2722 G>C (p.Gly908Arg);
•NOD2 (CARD15) — c.2104 C>T (p.Arg702Trp);
•ATG16L1 — c.898 A>G (p.Thr300Ala).
Дослідження дає змогу:
• визначити чотири конкретні генетичні варіанти, асоційовані зі схильністю до хвороби Крона;
• отримати додаткову інформацію про окремі генетичні особливості пацієнта;
• використовувати результати як дослідницькі дані під час вивчення генетичних асоціацій із хворобою Крона.
Генетичні асоціації не однаково виражені в різних популяціях. Їх клінічна значущість залежить від конкретного варіанта, його частоти в популяції та поєднання з іншими генетичними й популяційними чинниками.
Варіанти NOD2 пов’язані з розпізнаванням бактеріальних компонентів та регуляцією вродженої імунної відповіді. Варіант ATG16L1 T300A асоціюється зі змінами функціонування аутофагії — клітинного механізму, важливого для підтримання гомеостазу кишечника.
Генетичний профіль ризику хвороби Крона (NOD2 + ATG16L1)
Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі
венозна кров
За 4 години Витримати голодування, виключити жирну їжу. Можна пити воду. Для дітей до 1 року - бажано дотриматись максимально можливого проміжку між годуваннями, або безпосередньо перед наступним годуванням.
Для генетичного дослідження:
Аналітичні фактори
•недостатня кількість або низька якість виділеної ДНК може перешкоджати отриманню достовірного результату;
•інгібітори ПЛР, якщо цей метод застосовується, можуть пригнічувати ампліфікацію;
•контамінація сторонньою ДНК може спричиняти хибні або неоднозначні результати;
Обмеження аналітичного охоплення:
•метод виявляє лише ті варіанти, для яких він валідований, і не виключає інших генетичних факторів схильності.
Інтерпретацією результату повинен займатися кваліфікований фахівець, який чітко розуміє переваги та обмеження тесту, у контексті всіх клініко-анамнестичних даних. Неправильне використання тесту може збільшити ймовірність постановки помилкового діагнозу та призвести до непотрібних втручань і зниження якості життя пацієнта.
Для генотипування не застосовують референтний інтервал у звичному для біохімічних показників розумінні
Для цієї панелі досліджуються три варіанти NOD2 та один варіант ATG16L1. У бланку результату наведено клінічну інтерпретацію кожного варіанта. Зазначення гетерозиготного або гомозиготного стану можливе, якщо це передбачено форматом результату валідованого методу .Діагноз хвороби Крона встановлюють на підставі комплексної оцінки клінічних проявів та результатів обстежень. Залежно від клінічної ситуації діагностичний алгоритм може включати:
1.Лабораторні дослідження: загальний аналіз крові, С-реактивний білок, альбумін та інші показники за клінічними показаннями;
2.Дослідження калу, на фекальний кальпротектин лактоферин, а також ПЛР обстеження для виключення кишкових інфекцій, інвазій;
3.Ілеоколоноскопію з біопсією та гістологічним дослідженням;
4.Візуалізацію тонкої кишки — МР-ентерографію, КТ-ентерографію або кишкове ультразвукове дослідження залежно від доступності та клінічної потреби.
Генетичне дослідження NOD2 + ATG16L1 не замінює зазначені методи та не належить до основних діагностичних критеріїв хвороби Крона. Не слід використовувати результат як самостійну підставу для призначення, зміни або відміни терапії.Обмеження клінічного застосування:
• виявлення одного або кількох варіантів не підтверджує діагноз хвороби Крона;
• відсутність досліджуваних варіантів не виключає захворювання або інших генетичних чинників схильності;
• результат не визначає індивідуальну ймовірність розвитку хвороби, її активність, локалізацію, тяжкість чи ризик ускладнень;
• дослідження не є підставою для призначення, зміни або відміни лікування;
• клінічна значущість варіантів залежить від генетичного та популяційного контексту.
