Генетический профиль риска болезни Крона (NOD2+ATG16L1)

Болезнь Крона – это хроническое рецидивирующее иммуноопосредованное воспалительное заболевание желудочно-кишечного тракта мультифакториальной природы, развивающееся вследствие взаимодействия генетической предрасположенности, факторов окружающей среды и нарушений иммунного ответа. Характеризуется сегментарным (очаговым) и трансмуральным (с привлечением всех слоев стенки) воспалением, которое может поражать любой участок пищеварительного тракта – от полости рта до анального канала.
Важную роль в предрасположенности к болезни Крона играют генетические факторы. В частности, гены NOD2 и ATG16L1 принимают участие в распознавании бактериальных компонентов, регуляции иммунного ответа и поддержании нормального функционирования клеток кишечника. Некоторые варианты этих генов ассоциированы с повышенным риском развития заболевания.
Исследование «Генетический профиль риска болезни Крона (NOD2 + ATG16L1)» позволяет выявить четыре генетических варианта, связанных с предрасположенностью к этому заболеванию. Результаты могут дополнить клиническую оценку пациента и помочь врачу лучше понять генетические факторы риска в конкретной клинической ситуации.

Гены NOD2 и ATG16L1 участвуют в механизмах врожденного иммунитета и поддержании гомеостаза кишечника. Некоторые варианты этих генов ассоциируются с повышенным риском болезни Крона, однако их наличие не означает, что заболевание обязательно разовьется.

Значения генов NOD2 и ATG16L1:
NOD2 - распознавание бактериальных компонентов
Ген NOD2 кодирует внутриклеточный рецептор, распознающий мурамилдипептид – компонент бактериальной клеточной стенки – и участвует в регуляции врожденного иммунитета.
Три изучаемых варианта NOD2 (R702W, G908R и 3020insC) в популяционных исследованиях ассоциировались с повышенной предрасположенностью к болезни Крона. Для отдельных вариантов описана связь с поражением подвздошной кишки и определенными фенотипами заболевания. Однако генетический результат не позволяет достоверно предусмотреть индивидуальное течение заболевания.
ATG16L1 - аутофагия и кишечный барьер
Ген ATG16L1 кодирует белок, необходимый для аутофагии – процесса внутриклеточного удаления и переработки поврежденных компонентов и контроля микроорганизмов.
Варианты ATG16L1, в частности, распространенный полиморфизм p.Thr300Ala (T300A; rs2241880), ассоциируются с риском развития болезни Крона. Эта ассоциация отражает генетическую предрасположенность, а не активное воспаление кишечника.

Исследование этих генов позволяет определить наличие конкретных изучаемых вариантов генетической предрасположенности. Его клиническое значение зависит от перечня вариантов, входящих в тест, семейный анамнез и клиническую ситуацию.

Генетическое исследование «Генетический профиль риска болезни Крона (NOD2 + ATG16L1)» может рассматриваться в рамках специализированной оценки генетических факторов или научно-клинических программ:
1.У пациентов с семейным анамнезом болезни Крона – для определения отдельных генетических вариантов, ассоциированных со склонностью к заболеванию. В то же время исследование не является рекомендованным рутинным скринингом бессимптомных родственников;
2. У пациентов с подтвержденной болезнью Крона – для характеристики наличия исследуемых генетических вариантов в пределах специализированной оценки или научного протокола. Результаты не используются самостоятельно для определения прогноза или выбора терапии;
3.У пациентов, участвующих в научно-клинических исследованиях - для определения четырех генетических вариантов NOD2 и ATG16L1, включенных в исследуемую панель
Обратите внимание: при подозрении на болезнь Крона генетическое исследование NOD2+ATG16L1 не должно заменять или откладывать стандартное диагностическое обследование. Оно не рекомендовано в качестве самостоятельного теста для подтверждения или исключения заболевания.

Генетическое тестирование может быть полезным как дополнительный инструмент в выбранных клинических случаях, но не заменяет стандартные методы диагностики. Исследование не является методом диагностики болезни Крона, не позволяет установить ее активность, локализацию или прогнозировать индивидуальное течение. Отсутствие изучаемых вариантов также не исключает генетическую предрасположенность или наличие заболевания.

Метод применяется для генотипирования четырех изучаемых вариантов генов, ассоциированных с риском развития болезни Крона:
• NOD2 (CARD15) - c.3019_3020insC (3020insC);
• NOD2 (CARD15) - c.2722 G>C (p.Gly908Arg);
• NOD2 (CARD15) - c.2104 C>T (p.Arg702Trp);
• ATG16L1 - c.898 A>G (p.Thr300Ala).

Исследование позволяет:
• определить четыре конкретных генетических варианта, ассоциированных со склонностью к болезни Крона;
• получить дополнительную информацию об отдельных генетических особенностях пациента;
• использовать результаты в качестве исследовательских данных при изучении генетических ассоциаций с болезнью Крона.

Генетические ассоциации не одинаково выражены в разных популяциях. Их клиническая значимость зависит от конкретного варианта его частоты в популяции и сочетания с другими генетическими и популяционными факторами.
Варианты NOD2 связаны с распознаванием бактериальных компонентов и регуляцией врожденного иммунного ответа. Вариант ATG16L1 T300A ассоциируется с изменениями функционирования аутофагии – клеточного механизма, важного для поддержания гомеостаза кишечника.

Метод: Полимеразная цепная реакция в реальном времени