ОнкоТаргет Sarcoma, NGS

Патоморфологічна та онкологічна панель

ОнкоТаргет Sarcoma -  NGS-панель для молекулярного профілювання сарком та інших пухлин мезенхімального походження на основі аналізу РНК. Дослідження спрямоване на виявлення генних злиттів (fusion genes), транслокацій, перебудов, альтернативного сплайсингу та інших клінічно значущих молекулярних подій, які є драйверними механізмами розвитку багатьох сарком. Панель використовує технологію Anchored Multiplex ПЛР (AMP™), що дозволяє виявляти як відомі, так і нові партнерські гени без необхідності попереднього знання структури транслокації.

Саркоми належать до однієї з найгетерогенніших груп злоякісних новоутворень. Згідно з сучасною класифікацією ВООЗ, для значної частини сарком наявність специфічних генних перебудов є визначальним критерієм встановлення нозологічного діагнозу. Саме тому молекулярне тестування сьогодні є невід'ємною складовою комплексної патоморфологічної діагностики сарком.

Дослідження рекомендоване у таких клінічних ситуаціях:

• первинна діагностика сарком м'яких тканин та кісток;
• морфологічно складні або недиференційовані пухлини мезенхімального походження;
• випадки, коли імуногістохімічне дослідження не дозволяє однозначно встановити діагноз;
• уточнення підтипу саркоми відповідно до сучасної класифікації WHO;
• диференційна діагностика між саркомою та гістологічно подібними новоутвореннями;
• пошук молекулярних маркерів, асоційованих із потенційними терапевтичними мішенями;
• рецидивні або метастатичні саркоми;
• відбір пацієнтів для персоналізованого лікування та клінічних досліджень;
• повторна оцінка пухлин із невизначеним або сумнівним гістологічним висновком.

ALK, BCOR, BRAF, CAMTA1, CCNB3, CIC, CSF1, CTNNB1, EGFR, EPC1, ERG, ESR1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FOS, FOSB, FOXO1, FUS, GLI1, HMGA2, JAZF1, MBTD1, MDM2, MEAF6, MET, MGEA5, MKL2, MYOD1, NCOA1, NCOA2, NCOA3, NR4A3, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PAX3, PDGFB, PDGFRA, PHF1, PLAG1, PRKCA, PRKCB, PRKCD, RAF1, RET, ROS1, SS18, STAT6, TAF15, TCF12, TFE3, TFG, USP6, VGLL2, YAP1, YWHAE.

Саркоми належать до молекулярно неоднорідної групи злоякісних новоутворень, для значної частини яких наявність специфічних генетичних перебудов є ключовим діагностичним критерієм. Виявлення драйверних генних злиттів дозволяє не лише підтвердити діагноз, але й провести точну молекулярну класифікацію пухлини, оцінити прогноз та визначити потенційні терапевтичні опції.

Особливу цінність дослідження має для виявлення таких клінічно значущих перебудов, як:

• EWSR1-FLI1, EWSR1-ERG при саркомі Юїнга;
• SS18-SSX1/2/4 при синовіальній саркомі;
• FUS-DDIT3, EWSR1-DDIT3 при міксоїдній ліпосаркомі;
• FOXO1-PAX3, FOXO1-PAX7 при альвеолярній рабдоміосаркомі;
• COL1A1-PDGFB при дерматофібросаркомі;
• NTRK1/2/3-злиття при різних типах сарком;
• інші рідкісні та нові перебудови, що мають діагностичне або терапевтичне значення.

Відповідно до сучасного підходу, рекомендованого провідними міжнародними експертними спільнотами та інтегрованого в актуальні класифікації пухлин м'яких тканин і кісток, результати молекулярно-генетичного дослідження мають розглядатися разом із морфологічними та імуногістохімічними даними для встановлення остаточного діагнозу.

Важливою перевагою РНК-NGS-підходу є можливість одночасного виявлення широкого спектра відомих та нових генних злиттів без необхідності попереднього знання гена-партнера. На відміну від FISH або ПЛР, що орієнтовані на пошук окремих перебудов, дослідження дозволяє виконати комплексний аналіз транслокацій в одному тесті та підвищити діагностичну ефективність у складних клінічних випадках.

Результати дослідження можуть безпосередньо впливати на тактику ведення пацієнта:

• підтвердження або уточнення нозологічного діагнозу;
• молекулярна класифікація сарком відповідно до сучасних міжнародних стандартів;
• покращення точності диференційної діагностики складних та низькодиференційованих пухлин;
• оцінка прогностично значущих молекулярних змін;
• виявлення потенційних терапевтичних мішеней для персоналізованого лікування;
• відбір пацієнтів для участі у клінічних дослідженнях нових лікарських засобів;
• зниження ризику діагностичних помилок та вибору неефективної терапії.

Особливого значення набуває виявлення перебудов у генах NTRK1/2/3, ALK, ROS1, RET, FGFR, які можуть розглядатися як потенційні терапевтичні мішені та бути підставою для призначення таргетної терапії відповідно до чинних клінічних рекомендацій та доступних терапевтичних опцій.

Завдяки високій чутливості технології Anchored Multiplex ПЛР (AMP™) панель забезпечує надійне виявлення клінічно значущих молекулярних змін навіть у FFPE-зразках із низькою якістю нуклеїнових кислот та обмеженою кількістю пухлинного матеріалу. Дослідження підтримує сучасну концепцію прецизійної онкології та сприяє прийняттю більш обґрунтованих клінічних рішень щодо діагностики, прогнозування та лікування пацієнтів із саркомами.

ОнкоТаргет Sarcoma, NGS